בעקבות מלחמת לבנון השניה, מפצה מדינת ישראל עסקים ומוסדות, בפיצוי בגין נזקי המלחמה את מי שניזוק בישובי הצפון. ישובים אלו מחולקים לשתי קבוצות: ישובי הספר "הקלאסיים" וישובי אזור ההגבלה (ישובי הצפון  לרבות ישובי הספר, כשהם מדורגים לימי פיצוי לפי מרחק טווח הטילים שהלך וגדל). לישובי איזור ההגבלה נקבע בתקנות פיצוי ב"מסלול ירוק" קרי, בגין חודש יולי פיצוי בשיעור 132.5% משכר העובדים הנעדרים, ובגין חודש אוגוסט 145% כנ"ל. (ישנה התייחסות שונה לעובדי כוח אדם), או מסלול פגיעה במחזור בהכנסות בהשוואה למחזור חודש 8.2005 – על פי בחירת הניזוק.

לניזוקים בישובי הספר בלבד ניתנה האפשרות לבחור בתביעת פיצוי לפי המפורט לעייל, או בתביעת פיצוי בדרך של הוכחת נזק עקיף, בלא קשר לחלופות לעיל.

הפיצוי הינו הכנסה חייבת במס, מסכום הפיצוי ינוכה במקור מס בשיעור של 20% (למעט מקרה בו למקבל הפיצוי אישור מפקיד השומה על פטור מניכוי מס במקור או ניכוי בשיעור מופחת).

מצאנו לנכון להאיר  שתי סוגיות חשובות בהקשר לפיצוי:

האחת – תקנה 3(א)(1)(ח) לתקנות מע"מ קובעת במפורש כי פיצוי בעד נזק מלחמה לפי חוק מס רכוש אינו חלק ממחיר עסקאותיו של עוסק, קרי אינו חב במע"מ עסקאות. שאלה מיידית המתבקשת מכך הינה, האם תשלל אפשרות ניכוי מע"מ תשומות שבגינו נתקבל הפיצוי האמור?

לדעתנו בהתאם להוראת תאמ"ו מס 66.714 ובניגוד לפס"ד א.ג.מ.ק (ראה מבזק מס מס מספר 52 מיום 13.1.2004), יותרו מע"מ התשומות בגין תשומות ששולמו ב/לגבי תקופת המלחמה שלגביה ניתן הפיצוי.

השניה – רשות המיסים קובעת כי ההכנסה בגין הפיצוי תדווח "בדוח השנתי במועד קבלתו". מכאן כי אף שההוצאות שבשלהן נדרש הפיצוי ינוכו מההכנסה החייבת בשנת 2006, הפיצוי בגינן במידה ולא יתקבל בפועל בשנת 2006, לא ידווח כהכנסה חייבת לצורך מס (איננו מתייחסים ברשימה זו לדווח החשבונאי). הדבר בולט במיוחד במסלול הפיצוי המחושב בהתאם למשכורות ששולמו בזמן המלחמה.